Kunigas. Mokėsi Seinų kunigų seminarijoje, kunigu įšventintas 1899 m. lapkričio 16 d. Buvo Balbieriškio ir Prienų vikaru. Nuo 1920 m. Pakuonio ir Prienų klebonas. 1925 m. jam suteiktas garbės kanauninko, o vėliau ir prelato titulas. Kai Prienuose buvo dislokuotas 5-asis pėstininkų pulkas, J. Valaitis ėjo jo kapeliono pareigas. Taip pat buvo Vilkaviškio vyskupijos konsultorius.