The museum, situated on the banks of Lake Zarasai beside the Observation Wheel, attracts visitors of all ages. The Zarasai Regional Museum was founded in 1934. Visitors can learn more about the history of Zarasai, the notable people of the region, the facts and characteristics of the area's unique ethnic and minority groups, and the culture of the Selonian tribe. The museum features exhibits that present the region's four formerly active religious communities and local figures known for their achievements. These include, for example, artist Marc Chagall, artist and teacher Yehuda Pen, and collector Anton Brodowski. The museum also displays many fascinating exhibits connected with the Zarasai region during the First World War, the periods of struggles for Lithuanian independence, the formation of the state and the interwar, as well as the most significant events during the Soviet era and the restored Lithuanian independence.

The Zarasai Regional Museum has three branches: the Stelmužė Ecclesiastical Art Museum, the Centre of Crafts in the Antazavė Manor, and the Kazimieras Būga Memorial Museum.

1934 m. lapkričio 17 d. mokytojo S. Jauniškio iniciatyva Zarasų progimnazijos patalpose įkurtas muziejus, kuriame veikė numizmatikos, archeologijos, liaudies meno, spaudos, Didžiojo karo liekanų ir gamtos skyriai. Muziejus buvo sukaupęs apie 2 000 eksponatų.
1935 m. muziejų savo žinion perėmė Zarasų apskrities valdyba. Tuo metu muziejaus tvarkymu rūpinosi mokytojas A. Rapolis.
Po II-ojo pasaulinio karo liko tik viena spinta su keletu eksponatų. Muziejus neturėjo nuolatinio pastato, todėl jis kilnojamas iš vienos vietos į kitą.
1963 m. Kultūros ministro įsakymu Zarasų muziejus buvo uždarytas, eksponatai perduoti Rokiškio kraštotyros muziejui, kadangi fonduose buvo per mažai eksponatų, kad muziejus galėtų savarankiškai egzistuoti.
1969 m. mokyklos pastate atidarytas Marytės Melnikaitės memorialinis muziejus - Rokiškio kraštotyros muziejaus padalinys.
1987 m. muziejus pavadintas Zarasų krašto muziejumi ir faktiškai pradėjo kurtis iš naujo. Muziejaus steigėjas – Zarasų r. savivaldybė.
2007 m. Zarasų krašto muziejuje įrengta nauja ekspozicija. Dizaineris dailininkas – architektas Petras Vytautas Zaranka. 
Muziejuje lankytojai gali apžiūrėti ekspozicijoje įamžintą krašto istoriją, etnografinę ekspoziciją, Rytų Aukštaitijos sakralinių skulptūrų salę, 2000 m. kovo 14 d. atidarytą kraštiečio dailininko M. J. Šileikio galeriją, kurioje eksponuojami dailininko kūriniai, asmeniniai daiktai.
Zarasų krašto muziejuje sukaupta per 15 tūkst. eksponatų.
Pagrindiniai muziejaus rinkiniai: istorijos, raštijos ir fotografijos, etnografijos, dailės, liaudies meno, numizmatikos.
Pagrindinės Zarasų krašto muziejaus veiklos kryptys: muziejininkystė, edukacinė veikla, renginiai ir parodinė veikla, projektinė veikla, leidybinė veikla.