Kaišiadorių muziejus įsteigtas 1998 metais. Muziejus tiria ir populiarina Kaišiadorių regiono kultūros istoriją, saugo ir visuomenei pristato šio krašto archeologines, istorines, etnografines bei menines vertybes.

Muziejaus archyve kaupiama mokslinių tyrinėjimų medžiaga, vaizdo, garso įrašai, fotomedžiaga, o bibliotekoje – leidiniai, atitinkantys muziejaus veiklos pobūdį.

Seniausi muziejaus eksponatai – iš Kalvių ežero pakrantės, kur ledynams ištirpus buvo įsikūrusios akmens amžiaus gyvenvietės, naujausi – susiję su Lietuvos Respublikos Prezidentu Algirdu Brazausku (1932–2010), kuris iki 1951 m. gyveno ir mokėsi Kaišiadoryse, o vėliau čia aplankydavo tėvų namus.

Kaišiadorių muziejus turi du padalinius: Jono Aisčio ekspoziciją ir Brazauskų namus-muziejų.