Muziejus veikia Zyplių dvaro vežiminės patalpose. Zyplių dvaro ansamblį (Tubelių kaimas, Lukšių sen., Šakių r.), įkurtą XIX a. viduryje, sudaro 11 išlikusių pastatų, kurie apsupti vieno iš didžiausių parkų su balzaminių tuopų ir skroblų alėjomis. 

Muziejų 1928 m. įkūrė zanavykų ateitininkai Šakių „Žiburio“ gimnazijoje, jos įkūrimo dešimtmečio proga. Muziejuje buvo eksponuojami darbo įrankiai, drabužiai, senoviniai pinigai, įvairūs dokumentai. 1944 m. gimnazijos pastatas ir jame įsikūręs muziejus sudegė. Vietos kraštotyrininkų iniciatyva 1986 m. muziejus buvo atkurtas Girėnuose (Šakių r.), pradėtos kaupti muziejinės vertybės. Rinkiniai pildomi ekspedicijų, vienos dienos išvykų metu, taip pat gaunami dovanų iš Zanavykų krašto žmonių. 

Pirmasis muziejaus aukštas skirtas Zanavykų krašto istorijai, žymiems žmonėms ir svarbiausiems įvykiams. Antrajame aukšte įrengta Etnografijos ekspozicija, atspindinti XVIII a. pab.–XX a. pr. Zanavykų krašto buitį. Eksponuojami tradiciniai zanavykų stubos (gyvenamojo namo) baldai. Čia pristatomi senoviniai buities reikmenys, namų apyvokos daiktai, staliaus ir kitų meistrų darbo įrankiai. 

Lankytojai muziejuje sužinos, kad zanavykai – tai šiaurės suvalkiečiai, gyvenantys netoli Novos upės (apie Kudirkos Naumiestį, Griškabūdį, Šakius). Šių vietų tarmė yra pati artimiausia bendrinei lietuvių kalbai, o Zanavykijos sostine laikomi Šakiai.