Marianos Puzinaitės ir Jokūbo Ignoto Nagurskio sūnus. Mirė 1796 m. spalio 26 d.

Nuo 1782 m. J. Nagurskis siekė politinės ir karinės karjeros. Buvo LDK pasiuntinys 1782, 1783, 1790, 1791 m. Abiejų Tautų Respublikos seimuose. 1791 m. tapo kavalerijos rotmistru. 

Nevedė ir nepaliko palikuonių.