Ant Zaraso ežero kranto prie apžvalgos rato įsikūręs muziejus yra traukos centras įvairaus amžiaus lankytojams. Muziejuje galima susipažinti su Zarasų miesto istorija, žymių krašto žmonių gyvenimu, savitos etninės bei tautinių mažumų kultūros faktais ir bruožais, sėlių genties kultūra. Muziejaus ekspozicijoje – eksponatai, liudijantys apie čia veikusias keturias religines bendruomenes, iš šių vietų kilusius savo pasiekimais plačiai žinomus žmones. Tarp jų – ir dailininkas Markas Šagalas (Marc Chagal), dailininkas, pedagogas Yjeguda Penas, kolekcininkas Antonas Brodovskis. Muziejuje taip pat daug įdomių eksponatų, pasakojančių apie Zarasus Pirmojo pasaulinio karo metais, kovų už Lietuvos nepriklausomybę, Valstybės kūrimo, tarpukario laikotarpiais, sovietmečiu ir atkurtos Lietuvos nepriklausomybės svarbiausius įvykius Zarasų krašte.

Muziejus įsikūręs 1931 m. istoriniame pastate, anuomet skirtame Aukštesniajai komercijos mokyklai. Zarasų krašto muziejus įsteigtas 1934 m. Zarasų progimnazijos patalpose. Per savo istoriją buvo niokotas okupacijų, padegtas, uždarytas, eksponatai buvo perduoti Rokiškio kraštotyros muziejui.

Zarasų krašto muziejus turi tris padalinius: Stelmužės bažnytinio meno muziejų, Amatų centrą Antazavės dvare, Kazimiero Būgos memorialinį muziejų.

1934 m. lapkričio 17 d. mokytojo S. Jauniškio iniciatyva Zarasų progimnazijos patalpose įkurtas muziejus, kuriame veikė numizmatikos, archeologijos, liaudies meno, spaudos, Didžiojo karo liekanų ir gamtos skyriai. Muziejus buvo sukaupęs apie 2 000 eksponatų.
1935 m. muziejų savo žinion perėmė Zarasų apskrities valdyba. Tuo metu muziejaus tvarkymu rūpinosi mokytojas A. Rapolis.
Po II-ojo pasaulinio karo liko tik viena spinta su keletu eksponatų. Muziejus neturėjo nuolatinio pastato, todėl jis kilnojamas iš vienos vietos į kitą.
1963 m. Kultūros ministro įsakymu Zarasų muziejus buvo uždarytas, eksponatai perduoti Rokiškio kraštotyros muziejui, kadangi fonduose buvo per mažai eksponatų, kad muziejus galėtų savarankiškai egzistuoti.
1969 m. mokyklos pastate atidarytas Marytės Melnikaitės memorialinis muziejus - Rokiškio kraštotyros muziejaus padalinys.
1987 m. muziejus pavadintas Zarasų krašto muziejumi ir faktiškai pradėjo kurtis iš naujo. Muziejaus steigėjas – Zarasų r. savivaldybė.
2007 m. Zarasų krašto muziejuje įrengta nauja ekspozicija. Dizaineris dailininkas – architektas Petras Vytautas Zaranka. 
Muziejuje lankytojai gali apžiūrėti ekspozicijoje įamžintą krašto istoriją, etnografinę ekspoziciją, Rytų Aukštaitijos sakralinių skulptūrų salę, 2000 m. kovo 14 d. atidarytą kraštiečio dailininko M. J. Šileikio galeriją, kurioje eksponuojami dailininko kūriniai, asmeniniai daiktai.
Zarasų krašto muziejuje sukaupta per 15 tūkst. eksponatų.
Pagrindiniai muziejaus rinkiniai: istorijos, raštijos ir fotografijos, etnografijos, dailės, liaudies meno, numizmatikos.
Pagrindinės Zarasų krašto muziejaus veiklos kryptys: muziejininkystė, edukacinė veikla, renginiai ir parodinė veikla, projektinė veikla, leidybinė veikla.